Seurat单细胞处理流程之六:hdWGCNA分析
```R rm(list = ls()) setwd(“/mnt/DEV_8T/zhaozm/seurat全流程/hdWGCNA/”)
```R rm(list = ls()) setwd(“/mnt/DEV_8T/zhaozm/seurat全流程/hdWGCNA/”)
```R rm(list = ls()) setwd(“/mnt/DEV_8T/zhaozm/seurat全流程/irGSVA/”)
在服务器上添加组用户(User Groups)的主要目的是管理权限、提高安全性和简化用户管理。在 Linux 服务器上,不同的用户需要访问不同的资源(文件、目录、应用程序等)。使用组可以批量管理权限,避免逐个设置用户权限的麻烦。同时,使用组可以限制某些用户的访问权限,防止未经授权的更改。
整体来说,单细胞的差异分析与普通转录组的差异分析流程类似,但是原理略有不同。 (补充几个常用包的原理和秩和检验的原理)
```R rm(list = ls()) setwd(“/mnt/DEV_8T/zhaozm/seurat全流程/降维注释”)
data_dir <- “/mnt/DEV_8T/zhaozm/seurat全流程/降维注释/data” if (!dir.exis...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据质量控制(Quality Control, QC)是分析流程中的关键步骤。由于单细胞测序技术存在一定的噪音和技术误差,质控的目的是去除低质量细胞和异常数据,提高后续分析的可靠性和生物学意义。
以pbmc示例数据为例: ```R rm...
单细胞数据格式主要划分为四大类:
zotero的网页插件在导入文献时非常好用,但有的时候,部分参考格式无法识别eng和en,导致出现中文的etal和等混乱,这时候我们可以使用其开发者工具进行修改。